Od stycznia 2008 roku Muzeum Sztuki Nowoczesnej w Warszawie prowadzi działalność w siedzibie tymczasowej w lokalu przy ulicy Pańskiej 3, w bezpośrednim sąsiedztwie Pałacu Kultury. Organizowane przez Muzeum wystawy, wydarzenia kulturalne i edukacyjne oraz wydawane publikacje służą wypracowaniu kompleksowego programu działalności w przyszłej siedzibie na Placu Defilad. Muzeum realizuje programy badawcze w zakresie historii sztuki najnowszej, sukcesywnie rozbudowuje swoją ofertę dla publiczności, skoncentrowaną na sztukach wizualnych, projektowaniu graficznym, wzornictwie i architekturze. Do kluczowych zadań Muzeum należy gromadzenie kolekcji dzieł sztuki, która prezentowana będzie w nowym gmachu.
Muzeum Sztuki Nowoczesnej w Warszawie jest państwową instytucją kultury utworzoną przez Ministra Kultury zarządzeniem nr 6 z dnia 29 kwietnia 2005 r. Dzięki intencjom władz Miasta Stołecznego Warszawy oraz Ministerstwa Kultury i Dziedzictwa Narodowego 30 października 2006 r. została podpisana przez Miasto i Ministerstwo umowa o współprowadzeniu Muzeum. Umowa ta określa ramy współpracy władz w zakresie organizacji, prowadzenia i finansowania Muzeum, a także zasady, na jakich będzie realizowana inwestycja polegająca na wzniesieniu budynku według projektu Christiana Kereza.
Przy Muzeum działa Rada Muzeum powołana przez Ministra Kultury 12 września 2005 r., w skład której wchodzą obecnie: prof. Magdalena Abakanowicz, arch. Michał Borowski, Adam Leszkiewicz, prof. dr hab. Krzysztof Michalski, dr Agnieszka Morawińska, prof. Adam Myjak, prof. dr hab. Andrzej K. Olszewski, Anda Rottenberg, Adam Szymczyk, prof. dr hab. Andrzej Turowski, Danuta Wawrzynkiewicz.
Dyrektorem Muzeum od 6 czerwca 2007 r. jest Joanna Mytkowska
