Program Biennale WRO przynosi zarówno zróżnicowany wybór aktualnej twórczości medialnej z całego świata jak i usystematyzowane prezentacje historyczne, monograficzne lub narodowe przygotowane specjalnie z myślą o Biennale WRO. W programie Biennale WRO są też prezentacje i sympozja poświęcone wybranym zagadnieniom z pogranicza kultury/sztuki współczesnej.
Znaczna część programu Biennale WRO jest wynikiem wyboru dokonywanego z propozycji otrzymanych bezpośrednio od artystów, którzy odpowiedzieli na zaproszenie do zgłaszania prac. Zaproszenie ma charakter otwarty i jest szeroko dystrybuowane. W odpowiedzi napływa zazwyczaj ok. 1500 prac i projektów, z ponad 60 krajów. Ze wszystkich otrzymanych propozycji dyrektor artystyczny, wraz z zespołem programowym dokonuje wyboru dzieł, które zaprezentowane zostaną podczas Biennale WRO. Jest to zazwyczaj ok. 80 do 100 prac, z których większość ma tu swoje międzynarodowe premiery; wybór ma charakter konkursowy, przyznawane są nagrody, których pula utrzymuje się na poziomie 5 000 – 8 000 Euro.
Odrębną, równie bogatą w propozycje programowe częścią Biennale WRO są prezentacje autorskie, programy kuratorskie, sesje tematyczne i wykłady. Zapraszani są kuratorzy, artyści i teoretycy, zamawiane są programy tematyczne, retrospektywy i prezentacje specjalnie z myślą o Biennale WRO.